個別技術紹介

Individual Technology

目的遺伝子クローン単離技術


谷内江 望
東京大学先端科学技術研究センター

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要旨

あらゆるDNAアセンブリ反応はその効率が完全でない。DNAアセンブリ反応後、ゲノム編集によって目的の反応産物をもつ微生物細胞クローンのみを選択的にラベル化し単離する技術を樹立した。

研究の内容

あらゆるDNAアセンブリ反応はその効率が完全でなく、アセンブリ反応産物を微生物細胞に導入し、クローン化とDNAシークエンシングによる評価を必要とする。したがって、反応効率の低いサンプルほど評価クローン数が増加し、このプロセスがボトルネックになる。アセンブリ反応産物に分子DNAバーコードを付加、反応産物プールを一斉に超並列シークエンシング技術で解析後、ゲノム編集によって目的の反応産物をもつ細胞をDNAバーコード依存的にラベル化し単離する選択的クローン単離技術を樹立した。これによって従来のDNAアセンブリプロセスを1000倍加速する。

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産業界などへのアピールポイント

長鎖DNAの構築(build)はDBTLサイクルの要であり、このプロセスの加速なくしては有用微生物生産プロセスのスケール化は見込めない。近年までにDNAアセンブリ後に目的のDNAアセンブリ産物を効率良く得る方法がなかったために、DNAアセンブリ自体の効率向上などが進められてきたが、様々なケースのDNAアセンブリに対して本質的にbuildプロセスを加速する方法はなかった。本技術はこれを突破する。

参考文献

Nishida K, Arazoe T, Yachie N, Banno S, Kakimoto M, Tabata M, Mochizuki M, Miyabe A, Araki M, Hara KY, Shimatani Z & Kondo A.: Targeted nucleotide editing using hybrid prokaryotic and vertebrate adaptive immune systems, Science 353, aaf8729(2016)

関連特許

特願2019-012268

最終更新日:2022年11月14日 12:31